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ゲル撮影・イメージング
電気泳動 & ウェスタンブロッティング 蛍光イメージング
DNAの蛍光撮影 タンパク質の蛍光撮影 蛍光WB ウェスタンブロッティング検出感度の違い 光源とフィルターの組み合わせ
電気泳動やウェスタンブロッティング解析で理想的なデータを得るためには、ターゲットの発現量や実験目的、使用する撮影装置に応じて検出方法を選択する必要があります。たとえばCBB染色されたタンパク質の電気泳動ゲルでは可視光による検出、蛍光染色されたDNAの電気泳動ゲルでは蛍光による検出、HRP検出を利用したウェスタンブロッティングでは発光検出方法といったように、実験目的と検出感度により検出試薬が異なってきます。最も重要なことは、検出方法、特に検出試薬に最適な光源とフィルターの組み合わせで、可視光・蛍光・発光のイメージングを行うことです。
ここではアトーの電気泳動・ウェスタンブロッティングシステムによりDNAやタンパク質を解析したデータを、アトーのイメージングシステムで撮影した結果を紹介します。
※ 各セクションの上部枠内に励起光源（例：UV、CyanoView等）とフィルター（例：Orange filter、595nm(BP) filter等）を記載しています。
※ 各画像の上部に蛍光染色試薬名を記載しています（試薬名は各社の登録商標です）。
※ 各画像の下部に撮影時の露光時間を記載しています。
蛍光染色イメージ（DNA）と光源やフィルターの影響
1.2％アガロースゲル（1×TAE)でDNAのサイズマーカーを泳動し、泳動後のゲルを様々な蛍光試薬で３０分間染色したゲルを、撮影した結果を示しています。EzPreStain DNA＆RNAは泳動バッファーに添加し、泳動中に先染めしています。
上段はUV光源、下段はシアン光源で励起し、同じ装置、フィルターを使用して撮影した画像です。蛍光染色試薬により検出感度が異なるだけではなく、光源との組み合わせによる影響も大きいことが分かります。
WSE-5400 Printgraph Classicにより撮影
下図はシアン光源を使用した場合でも、2次フィルターの違いにより、露光時間が異なり、S/N比が変わる場合があります。
WSE-5300A Printgraph CMOS Ⅰにより撮影
下図はカラー撮影をしたイメージです。2次フィルターを通した撮影像のため、色素本来の色ではありませんが、蛍光色素による違いがわかります。
WSE-5400 Printgraph Classicにより撮影
使用製品
WSE-7130 EzFluoroStain DNA
WSE-7135 EzPreStain DNA&RNA
WSE-1710 サブマージ ミニ
WSE-5300A Printgraph CMOS Ⅰ
WSE-5400 Printgraph Classic
WSE-5600 CyanoView
※他の撮影装置でも同様のデータが撮影できます。製品名をクリックしてご確認ください。
WSE-5300A Printgraph CMOS Ⅰ
WSE-6270 LuminoGraph ⅡEM
EtBrとEzFluoroStain DNA/EzPreStain DNA＆RNAの比較
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EcoRIもしくはEcoRI/BamHIで制限酵素処理したClucベクターを1.2％アガロースゲル（1×TAE)でを泳動し、泳動後のゲルを様々な蛍光試薬で３０分間染色したゲルを、撮影した結果を示しています。EzPreStain DNA＆RNAは泳動バッファーに添加し、泳動中に先染めしています。EzFluoroStain DNAは蛍光強度も検出感度も高いため、バンドがスメアに見えることがあります。そのような場合は露光時間を短縮すると（1/2～1/8）、EtBr同等のイメージが撮影できます。一方、EzPreStain DNA＆RNAの検出感度はEtBrと同等です。 使用製品 CL-VVMC Clucプロモーターレスベクター(pCL Vector) WSE-7130 EzFluoroStain DNA WSE-7135 EzPreStain DNA&RNA WSE-1710 サブマージ ミニ WSE-5400 Printgraph Classic WSE-5600 CyanoView |
EtBr と EzPreStain DNA&RNAの検出感度
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EcoRIもしくはEcoRI/BamHIで制限酵素処理したClucベクターを1.2％アガロースゲル（1×TAE)でを泳動し、泳動後のゲルを様々な蛍光試薬で３０分間染色したゲルを、撮影した結果を示しています。フィルターや励起光源に依存しますが、 図に示したように、EzPreStain DNA＆RNAの検出感度はEtBrと同等です。 使用製品 CL-VVMC Clucプロモーターレスベクター(pCL Vector) WSE-7130 EzFluoroStain DNA WSE-7135 EzPreStain DNA&RNA WSE-1710 サブマージ ミニ WSE-5400 Printgraph Classic WSE-5600 CyanoView |
タンパク質の染色イメージ
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※他の撮影装置でも同様のデータが |
CBB染色（EzStain AQua）および各蛍光染色液で染色したゲルを、表示した光源とフィルターの組み合わせで撮影した画像を示しています。 サンプル Lane 1, 14: EzProtein Ladder Lane 2, 13: EzStandard Ⅱ Lane 3, 12: EzLabelFluoroNeo添付マーカー Lane 4, 5: Chick muscle protein Lane 6, 7: E. Coli extract protein Lane 8, 9: HeLa cell extract protein Lane 10, 11: Chick muscle protein 使用製品 AE-1340 EzStain AQua WSE-7020 EzProtein Ladder WSE-7015 EzStandard Ⅱ WSE-7010 EzLabel FluoroNeo AE-6530 ラピダス ミニスラブ電気泳動槽 WSE-3100 PowerStation Ghibli I WSE-5400 Printgraph Classic WSE-5600 CyanoView FLAT Viewer |
リン酸化タンパク質の検出
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ProQ Diamondでリン酸化タンパク質を検出した後に、同じゲルをSYPRO Rubyで染色した結果を示しています。重ね合わせたイメージはCS Analyzerで作成しました。 サンプル Lane 1, 14: EzProtein Ladder Lane 2, 13: EzStandard Ⅱ Lane 3, 12: EzLabelFluoroNeo添付マーカー Lane 4, 5: Chick muscle protein Lane 6, 7: E. Coli extract protein Lane 8, 9: HeLa cell extract protein Lane 10, 11: Chick muscle protein 使用製品 WSE-7020 EzProtein Ladder WSE-7015 EzStandard Ⅱ WSE-7010 EzLabel FluoroNeo AE-6530 ラピダス ミニスラブ電気泳動槽 WSE-3100 PowerStation Ghibli I WSE-5400 Printgraph Classic WSE-5600 CyanoView |
蛍光標識タンパク質の検出
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Cy2でラベルした肝細胞抽出液、Cy3でラベルした大腸菌抽出液、Cy5でラベルした血漿サンプルを電気泳動し、蛍光ラベルされたタンパク質をそれぞれに適した励起波長とフィルターの組み合わせで撮影した結果を示しています。重ね合わせたイメージはCS Analyzerで作成しました。
使用製品：
WSE-6270 LuminoGraph ⅡEM
AE-6530 ラピダス ミニスラブ電気泳動槽
WSE-3100 PowerStation Ghibli I
蛍光ウェスタンブロッティングの検出
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大腸がん由来細胞株（Colo205）からEzProteoExtract Nativeを使用してタンパク質を抽出し、 EzLabel FluoroNeoで標識し、 未ラベル、およびラベルしたサンプルの１/２希釈系列を、4~20%の濃度勾配ゲル（UH-T420）で分離しました。EzFastBlot HMWを使用して、ClearBlot膜（低蛍光）に転写し、EzBlockCASで室温で30分ブロッキング後、それぞれのターゲットに対する1次抗体および蛍光標識2次抗体と反応して検出た結果を示しています。
サンプル
使用製品 |
蛍光ウェスタンブロッティングの検出
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10ng/ レーンからの1/2 希釈系列で泳動したトランスフェリンタンパク質を、抗トランスフェリン抗体でウェスタンブロッティングした結果を示しています。HRP発光基質と反応後に発光撮影、もしくは近赤色、青色または赤色LED で励起して蛍光撮影した撮影イメージです。
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ATTO推奨撮影条件
※表内の「Ex」は「 励起波長」、「Em」は「蛍光波長」を示しています。
